Répertoire du personnel

Kurt Jordaens

Biologie
Invertébrés

SYRPINTINE

Etude des interactions syrphes-plantes introduisant les technologies de séquençage de nouvelle génération

Contexte et objectifs généraux Les syrphes (Diptera, Syrphidae), comme celles du genre Eristalinus, forment une des plus importantes groupes d’insectes qui accomplissent la fécondation des fleurs. Malheureusement, peu est connu sur leurs biologie de fécondation et le plus important raison pour ce manque c’est que leurs taxonomie est mal connue. Cependant, une identification exacte est très importante pour étudier les interactions entre les plantes et les insectes pollinisateurs. Malheureusement la majorité des espèces ne peuvent pas être identifier en utilisant des caractéristiques externes de la morphologie. Les techniques modernes ADN (dite les techniques de séquençage de nouvelle génération ou NGS) sont utilisées de plus en plus pour identifier les insectes et pour améliorer leur taxonomie. Une fois que les espèces différentes du genre Eristalinus peuvent être identifier plus facile, la collection du pollen sur les syrphes peuvent être utiliser pour caractériser leur régime. L’identification des plants sur la base des grains de pollen est toutefois très difficile. En utilisant les techniques de NGS nous essayerons d’identifier les grains de pollen en séquencer les code-barres génétiques d’ADN. Dans ce projet on va explorer plusieurs techniques de NGS pour améliorer la taxonomie des syrphes du genre Eristalinus, et pour caractériser les régimes des différentes espèces. Plus spécifique, les objectives du projet sont: Le développement des protocoles morphologiques et NGS pour identifier les espèces de syrphes du genre Eristalinus de la région afrotropicale. Le développement des protocoles morphologiques et NGS pour identifier les espèces de plantes de la région sud du Bénin, ainsi que pour les grains de pollen. Caractériser la régime des différentes espèces des syrphes du genre Eristalinus dans la région sud du Bénin. Méthodologies Général Les syrphes, les plantes et les grains de pollen seront collectionnées pendant plusieurs expéditions dans le sud du Bénin. Tous les individus seront déposer dans les collections de plusieurs musées et institutions comme c’est prévu par le comité international du ‘Barcode of Life’ (iBOL; http://ibol.org). Les syrphes ainsi que les plantes seront identifiées initial à la base de caractéristiques morphologiques. Après, des échantillons de tissu seront prises pour l‘extraction d’ADN pour les analyses génétiques. Grains de pollen seront utilisés pour composer une base de données palynologique. On va prendre des images scannées SEM des grains de pollen collectionnés sur les syrphes, ou dans leurs estomacs, et l’ADN va être extraher pour la mise au point des protocoles NGS. Le projet comprend trois parties (Work Packages ;WP). WP1 : L’usage de RAD-seq pour l’identification des espèces afrotropicale des syrphes du genre Eristalinus L’analyse de ‘Restriction-site-associated DNA’ (RAD-seq) permet à genotyper des milliers de SNP (pour Single Nucleotide Polymorphism). Jusqu’à présent, cette technologie n’a jamais été appliquée sur les syrphes. Les données seront être utilisées 1) pour résoudre les relations phylogénétiques entre les espèces du genre Eristalinus, 2) à clarifier la taxonomie de ce genre, et à évaluer les caractéristiques morphologiques qui sont utilisées pour le moment à identifier les espèces différentes. Les résultats de cette partie vont être utiliser pour résoudre la taxonomie de ce genre d’une manière intégrée, c'est-à-dire par une combinaison des données morphologiques et moléculaires.

Investigateur principal:

  • Kurt Jordaens
  • Dates:

    2014 2017

    Collaborateurs:

    Partenaires externes:

    Steven Janssens - Plantentuin Meise