Pollet, Y.,  Mathys, A.,  Gressin, A.,  Muth, X.,  Brecko, J.,  Dekoninck, W.,  Vandenspiegel, D.,  Jodogne, S. & Semal, P. 2026. ‘3D et pseudo 3D dans la numérisation des arthropods’. CIFE XI – L’entomologie face à la globalisation et à l’approche une seule santé. Book of abstracts. Liège.

Conference abstract

La numérisation des collections représente un défi majeur pour les institutions de sciences naturelles. Grâce aux diverses techniques développées au fil des années, la plupart des spécimens de collection peuvent désormais être numérisés de manière efficace. Toutefois, les arthropodes constituent toujours un cas difficile en raison de la complexité de leur petite taille, des structures et de la texture, qui peuvent être petites, fines, velues, transparentes, brillantes ou sombres. Par conséquent, les flux de numérisations existants sont limités pour permettre la prise de mesures précises, comme le demande la géométrie morphométrique. Les acquisitions 3D des arthropodes sont souvent limitées car elles ne capturent pas la texture (micro-ct) ou ont une précision relative dans les mesures (scan surfaciques, photogrammétrie avec modèles 3D). Basée sur une acquisition de photogrammétrie par images empilées en haute résolution, l'application Sphaeroptica a été développée en revenant aux principes fondamentaux de la photogrammétrie, sans la création d'un modèle 3D. Sphaeroptica fonctionne comme un visualiseur pseudo 3D basé sur une sphère d'images 2D orientées, permettant aux utilisateurs d'observer les spécimens dans toutes les orientations et d'effectuer des mesures géométriques 3D. Il permet d'afficher efficacement des structures complexes telles que les chaetae et les soies, en utilisant des images à profondeur de champ étendues en haute résolution plutôt qu'un modèle 3D calculé et simplifié. La comparaison métrique des mesures obtenues avec Sphaeroptica dans plusieurs études de cas montre que les écarts avec celles mesurées sur des modèles 3D haute résolution issus d'images de microtomographie sont inférieurs à 1 % tout en apportant les informations de couleur. Sphaeroptica apparaît ainsi adapté à la réalisation de mesures précises sur des spécimens petits et complexes, tels que les arthropodes. Afin d'améliorer la qualité visuelle de l'observation 3D, il est également possible d'utiliser le gaussian splatting en représentant un modèle 3D non pas avec des surfaces (polygones), mais avec une multitude de petites « taches » floues (gaussiennes) dans l'espace. Cette approche donne une fluidité dans l'observation du spécimen digital mais ne peut être utilisée pour des mesures précises. Dans ce cas, le retour aux images 2D à haute résolution est nécessaire. En combinant la précision de Sphaeroptica et la visualisation du Gaussian splatting, il sera bientôt possible d'observer et mesurer les spécimens digitaux d'arthropodes dans une réalité augmentée mais scientifiquement valide.